/usr (user) est le répertoire destiné a priori a des éléments disponible pour les utilisateurs, on y trouvera donc des sous répertoires BIN, LIB ,ETC , VAR .... l'organisation de ce répertoire peux varier énormément en fonction de la distribution, mais aussi de vos choix en matière de sécurité.

Toutefois , c'est le plus souvent dans /usr/src/linux (un lien symbolique vers /usr/src/linux-x.x.x) que sont installées les sources du kernel si elles sont installées.C'est en tout cas a cet endroit que plusieurs scripts nécessaires à la compilation s'attendent de trouver les sources du kernel - pensez donc à modifier les makefiles si vous voulez compiler ailleurs.

note1 : le sous répertoire générique des binaires pour une installation par un simple utilisateur est souvent /usr/local/bin ; /usr/bin étant souvent protégé en écriture (notamment chez suse). si ça pose des probs avec certain progs ou scripts d'installation, modifier les, ou faites ça en root.